Når André mister begge foreldrene i en bilulykke, havner han hos farens onkel. Med lapp over øyet og et altfor stort inntak av rom, lyder onkelen bare kallenavnet Piraten. Hvem som egentlig er den ansvarlige av de to, er uklart. Etter det første foreldremøtet blir Piraten i hvert fall aldri invitert til nye skolearrangementer.

En dag blir Piraten syk og alt ser relativt svart ut. På Trinidad bor Båtsmann, Piratens bestekompis, og det sies at han har helbredende evner. Piraten og André legger ut på sitt livs seilas der både monsterbølger og malstrømmer må forseres dersom de skal klare å nå målet: å få Piraten frisk.  

Min venn piraten er en burlesk røverhistorie med fantastiske karakterer og humor fra en helt særegen nesten-debutant.